Evaluación filogenética del BVDV circulante en ganado bovino

La diarrea viral bovina (BVD) es una enfermedad endémica que ocasiona importantes pérdidas económicas a la industria ganadera en muchos países del mundo. El agente causal es un Pestivirus conocido como virus de la diarrea viral bovina (BVDV), el cual presenta dos genotipos (BVDV-1 y BVDV-2) que, según estudios filogenéticos, han sido divididos a su vez en varios subgenotipos.

Evaluar la diversidad genética de un patógeno circulante en una población tiene gran utilidad para el desarrollo de programas de control, sobre todo en lo referente al establecimiento de estrategias vacunales.

En España, existen estudios previos sobre la variabilidad genética del BVDV entre los años 2000 y 2015, determinándose la presencia de ambos genotipos, siendo BVDV-1 el más frecuente, mientras que el BVDV-2 solo se ha detectado de forma puntual. Sin embargo, cabe destacar que la mayoría de estos datos provienen de animales procedentes principalmente de la zona norte de España.

Con el fin de incrementar y actualizar esta información, se procedió a evaluar el genotipo de BVDV presente en los 119 casos clínicos positivos a Pestivirus identificados, durante los años 2015-2019.

Se evaluaron un total de 110 muestras procedentes de 25 provincias españolas y, adicionalmente, 9 muestras de Portugal.
La determinación del genotipo BVDV-1 y BVDV-2 se realizó mediante dos kits comerciales de PCR en tiempo real.

Adicionalmente, en 41 casos seleccionados se determinó el subgenotipo de BVDV mediante la secuenciación y el análisis de la región 5´UTR, usando una metodología previamente descrita por Letellier et al.

Las muestras positivas a Pestivirus fueron obtenidas de animales con diferentes edades y patologías (Tabla 1). Sin embargo, la patología más frecuente fue la de tipo respiratorio (59/119), seguido de la digestiva (33/119).

Por otro lado, se observó que el número de casos positivos fue mayor en el grupo de animales con más de 45 días (69%) que en aquellos menores de 45 días (31%).

Según los resultados de los ensayos de PCR en tiempo real (qPCR), el 95% (105/110) de los casos españoles fueron positivos a BVDV-1,
mientras que solo dos fueron positivos a BVDV-2; adicionalmente,
4 casos resultaron negativos a ambos ensayos de qPCR.
Un resultado similar fue obtenido para las muestras de

Portugal, donde ocho de los nueve casos fueron positivos a BVDV-1 y solo uno fue positivo a BVDV-2. La secuenciación de la región 5´UTR se realizó en un total de 40 casos clínicos procedentes de 11 CC. AA. y 21 provincias españolas diferentes, con el fin de evaluar la distribución del genotipo de BVDV en toda la geografía nacional. Estos casos seleccionados incluyeron 37 positivos a BVDV-1, 2 positivos a BVDV-2 y un caso negativo a los dos ensayos usados para genotipar. Adicionalmente, se secuenció un caso de Portugal positivo a BVDV-2. BVDV-1 El análisis filogenético de las secuencias de los 37 casos españoles identificados mediante qPCR como BVDV-1, confirmó su pertenencia a dicho genotipo y permitió además su clasificación en los subgenotipos: 1a (n=2) 1b (n=30) 1e (n=4) 1f (n=1) Nuestros resultados corroboran al subgenotipo 1b como el más frecuente y el más extendido por España (Figura 1), tal y como se había descrito previamente. Se debe mencionar que el subgenotipo 1b ha sido descrito como el más extendido por Europa y está presente en muchos países, entre los que se encuentran Portugal e Italia. Por otro lado, cabe resaltar que los subgenotipos 1c, 1d, 1h, 1k, 1l y...

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